Nautilus оснащены высокоточными механизмами, разработанными Patek Philippe. Многие модели имеют автоматический калибр с запасом хода до 60 часов. Часы отличаются надежностью и точностью, что подтверждено сертификатом Patek Philippe Seal. Механизмы собираются вручную мастерами-часовщиками.